La monarquia organizo todo el comercio con las Indias en regimen de monopolio español, centralizado en la Casa de Contratacion de Sevilla.
Salian dos flotas protegidas con escolta, que tenian sus destinos en Cartagena de Indias y Veracruz. Estas flotas se cargaban en esos puertos. de productos del Nuevo Mundo y regresaban pasando por La Habana, donde tambien se cargaban con productos de las Antillas.
Este monopolio encarecio mucho las mercancias, por lo que se inicia el contrabando, y los colonos prefirieron los productos de otros paises europeos que llegaban a contrabandear en los mares del Caribe. Finalmente el comercio en America, fue controlado por banqueros extranjeros, especialmente genoveses.